女子高生の鎧 美刀は、「楽しく生きる」をモットーに高校生活を送っていた。だがある日、予期せぬ事件に巻き込まれ、その人生は一変してしまう……。
託された命運を握る赤ん坊。その裏に隠された真実と暗躍する組織。天才大学生・諸星一兵の科学力を味方に、美刀は巨大な的に立ち向かう――。