電脳騎士アルゴと一体になった高校生が、電脳世界の敵とバトルを繰り広げるアクショアドベンチャー。秋葉原にある万世橋学園高校に通う自称天才ゲーマー・基町走太郎（もとまち・そうたろう）は、知り合いである軍部（ぐんべ）の店で謎の基板を発見する。その時、近くでチャットをしてた走太郎の幼なじみ・秋川理沙（あきかわ・りさ）は、アルゴという謎のメッセージをフロッピーディスクに記録するが……!?